改為郎中，副理事官改為員外郎，《額者庫》改為主事。又初設滿洲、漢軍啟心郎，後俱裁。又初設他赤哈哈番筆帖式，哈番，後改設六品、七品、八品無頂帶筆帖式。各部院衙門同。
正官
滿、漢尚書各一員。初制增減不一。順治五年，定滿、漢各一員。七年，增滿洲一員。十年裁。
滿、漢左、右侍郎各一員。初制增減不一。順治十五年，定滿、漢左右各一員。
首領官
滿、漢司務各一員。初設漢司務二員。順治四年裁一員。十五年，定滿、漢各一員。各部院司務建革同。
屬官
滿洲、蒙古、漢軍司官筆帖式，不論司分，悉聽堂官調撥。漢司官仍論司分，各部院同。
滿郎中八員，初設四員。順治十二年增四員。漢軍郎中二員 。滿員外郎八員。
初定不分滿洲、蒙古陞補。順治十二年，止設滿洲八員。十八年，復設蒙古八員。康熙元年，蒙古缺裁。
漢軍員外郎六員 ，滿主事八員。堂主事，滿、文二員，滿、漢、文二員，司主事四員。
漢軍主事一員，係「堂主事。」
文選清吏司
漢郎中一員 ，漢員外郎一員。
漢主事二員
考功清吏司
漢郎中一員 ，漢員外郎一員。
漢主事一員
驗封清吏司
漢郎中一員 ，漢員外郎一員。
漢主事一員
稽勳清吏司
漢郎中一員 ，漢員外郎一員。
漢主事一員
滿筆帖式六十五員。內滿文三十二員，滿、漢文三十三員。
蒙古筆帖式二員 ，漢軍筆帖式十六員，戶部正官。
滿、漢尚書各一員。初制增減不一。順治五年，定滿、漢各一員。七年，增滿洲一員。十年裁。康熙六年，復增滿洲一員。八年裁。
滿、漢左、右侍郎各一員。初制增減不一。順治元年，定滿、漢左右各一員。
滿、漢總督倉場侍郎各一員。初設漢侍郎一員。康熙七年裁，止設滿侍郎一員。八年，定滿、漢侍郎各一員。
首領官
滿漢司務各一員
屬官
滿郎中二十二員。初設十員。順治元年後，續增十二員。內管理銀庫、緞庫、顏料庫各一員。蒙古郎中三員 。漢軍郎中二員。
滿員外郎三十九員。初設十六員。順治元年後，續增二十三員。內管理三庫各一員。
蒙古員外郎五員 ，漢軍員外郎六員，滿主事十八員。堂主事，滿、文二員，滿、漢文二員。司主事十四員。
漢軍主事二員，係「堂主事。」
滿司庫六員。初三庫各設三員，康熙八年各裁一員。
江南清吏司
漢郎中一員 ，漢員外郎一員。
漢主事一員
浙江清吏司
漢郎中一員 ，漢員外郎一員。
漢主事一員
江西清吏司
漢郎中一員 ，漢員外郎一員。
漢主事一員
湖廣清吏司
漢郎中一員 ，漢員外郎一員。
漢主事一員
福建清吏司
漢郎中一員 ，漢員外郎一員。
漢主事一員
山東清吏司
漢郎中一員 ，漢員外郎一員。
漢主事二員
山西清吏司
