殿，制敕、誥敕兩房，亦多有帶銜者。
吏科都給事中一員，左、右給事中二員，給事中四員。 戶科都給事中一員，左、右給事中二員。給事中六員。 舊八員。萬曆九年革四員。十一年，復設二員。
禮科，都給事中一員。左、右給事中二員，給事中五員。 舊六員。萬曆九年革二員。十一年，復設一員。
兵科，都給事中一員。左、右給事中二員，給事中七員。 舊十員。萬曆九年革五員。十一年，復設二員。
刑科，都給事中一員，左、右給事中二員。給事中六員。 舊八員。萬曆九年革四員。十一年，復設二員。
工科都給事中一員，左、右給事中二員，給事中四員， 承天門待詔一員，閣門使四員，觀察使十員。後俱革 欽天監
正官監正一員，監副二員。
首領官：主簿一員。
屬官：春夏、中、秋冬官正各一員。《五官》靈臺郎四員。舊 八員。《五官》保章正，一員，舊二員。《五官》挈壺正，一員，舊 二員。《五官》監候二員，舊三員；《五官》司曆二員。《五官》司 晨二員，舊八員。漏刻博士一員。舊六員。舊有「回回監 官，後俱革，止設回回科博士三員。今亦革。」
太醫院：
正官院。使一員。院判二員。舊一員。
首領官吏目十員。
舊止一員，後以醫士年深考陞。不拘定員。在內於《聖 濟殿》，在外於本院，及各差供事。隆慶五年定為十員。 《屬官》御醫十員。舊止四員，後增至十八員。隆慶五年 定為十員。
所屬衙門：「惠民藥局」，大使、副使各一員。生藥庫，大使、 副使各一員。
上林苑監。
正官監正二員，左、右監副二員，左、右監丞二員。後監 正、監副俱不常設，止設監丞署。掌印信。
首領官：典簿一員。
屬官：良牧署典署一員，久住補。署丞一員，舊二員，錄 事一員，舊二員，後革一員，萬曆九年盡革，十一年復 設一員。蕃育署署丞一員，舊二員，錄事一員，舊二員， 後革一員，萬曆九年盡革，十一年復設一員。舊有典 署一員，隆慶元年革。林衡署典署一員，久住補。署丞 一員，舊二員，舊有錄事二員，後革。嘉蔬署署丞一員， 舊二員。舊有典署、錄事各一員，嘉靖三十一年革。 中、左、右、前、後五軍都督府經歷司經歷各一員，都事 各一員。斷事司，後革。舊有斷事官一員，左、右斷事官 二員，提控案牘二員，司務二員，司獄一員。中、左、右、前、 後五司稽仁、稽義、稽禮、稽智、稽信各一員。後俱革 錦衣衛。
經歷一員。
各《衛》。
經歷各一員，共七十三員。舊各有知事一員、革。濟州 等五衛、各添收糧經歷一員。萬曆九年革
倉。
副使各一員。舊有大使各一員，後革。
京衛武學：
教授一員，訓導四員。舊六員，留守中等衛各門千戶 所。舊有吏目各一員，後革。
牧馬千戶所、蕃牧千戶所、奠靖千戶所吏目各一員。 「中、東、西、南、北五城兵馬指揮司」〈惟中城止稱中兵馬指揮司〉 正官指揮各一員，副指揮各四員。舊各四員，後增至 六員。嘉靖三十六年，五司各革一員。隆慶二年，五司 各革一員。今各設四員。
首領官吏目各一員。
僧錄司。
左右「善世」，二員，左右「闡教」，二員，左右「講經」，二員，左右 「覺義」，二員。俱不支俸。
道錄司。
左右正一，二員，左右「演法」，二員，左右「至靈」，二員，左右 「元義」，二員。俱不支俸。
神《樂觀》：
提點一員，知觀二員。
南京：
南京官裁減不一。今止書其見設者
南京宗人府：
經歷一員。
南京吏部：
尚書一員，右侍郎一員。萬曆三年革。十一年復設司 務一員。
文選司。郎中、主事各一員
驗封司郎中一員。舊有主事一員，隆慶四年革。 稽勳司郎中一員。舊有主事一員，後革。
考功司。郎中、主事各一員
南京戶部：
尚書一員，右侍郎一員。嘉靖二十六年、革「南京糧儲
