都御史，以本部侍郎督理糧儲」
司務一員，照磨一員。
浙江司、福建司，郎中、員外郎、主事各一員。
江西司郎中一員，員外郎一員。隆慶四年革。萬曆十 一年復設。主事二員。舊一員
湖廣司郎中一員，員外郎一員。萬曆九年革。十一年 復設主事一員。
廣東司郎中、員外郎各一員，主事一員。舊一員管「黃 冊」，隆慶三年革一員。
廣西司郎中一員。舊有員外郎一員。隆慶三年革。主 事二員。內一員管《黃冊》
河南司、山東司、四川司、貴州司，郎中、主事各一員。 山西司郎中一員，「舊有員外郎一員，嘉靖三十七年 革主事二員，內萬曆九年革一員，十一年復設。」 陝西司郎中一員，舊有員外郎一員，嘉靖三十七年 革主事一員。
雲南司郎中一員。舊有員外郎一員。隆慶四年革主 事二員。內萬曆九年革一員，十一年復設
所屬衙門：寶鈔提舉司，舊有提舉一員，隆慶三年革， 歸併九庫大使兼管。廣積庫大使一員。承運庫大使 一員。贓罰庫大使一員，甲、乙、丙、丁、戊字庫大使各一 員。寶鈔廣惠庫大使一員。軍儲倉舊有大使一員，隆 慶三年革。長安門倉副使一員。東安、西安、北安門倉， 舊有副使各一員，隆慶三年革。龍江鹽倉檢校批驗 所。大使一員。
南京禮部：
尚書一員，右侍郎一員。萬曆三年革。十一年復設司 務一員。
儀制司，郎中一員，主事一員。隆慶四年革。萬曆十一 年復設。
祠祭司，郎中一員，主事一員。萬曆九年革。十一年復 設。
主客司。郎中一員。
精膳司、郎中一員：
所屬衙門：行人司，左司副一員。鑄印局副使一員。教 坊司右韶舞一員。左、右司樂各一員。
南京兵部：
尚書一員，右侍郎一員。萬曆三年革。十一年復設司 務一員。
武選司郎中、主事各一員
職方司郎中、員外郎、主事各一員。
車駕司，郎中、員外郎各一員，主事二員。
武庫司。郎中、主事各一員
所屬衙門：「典牧所提領，一員；會同館大使，一員；大勝 關大使，一員。」
南京刑部。
尚書一員，右侍郎一員。萬曆三年革。十一年復設司 務一員，照磨一員。
浙江司郎中一員。舊有員外郎一員，隆慶三年革。主 事一員，萬曆九年革，十一年復設。
江西司郎中一員。舊有員外郎一員。隆慶三年革主 事一員
福建司、山東司、山西司，郎中、主事各一員。
湖廣司郎中一員，主事一員。萬曆九年革。十一年復 設。
廣東司郎中、員外郎各一員，主事一員。舊二員，隆慶 三年革一員。
廣西司，郎中一員，主事一員。萬曆九年革，十一年復 設。
河南司郎中一員。舊有員外郎一員，嘉靖三十七年 革。主事一員，萬曆九年革，十一年復設
陝西司郎中一員。舊有員外郎一員。嘉靖三十七年 革主事一員
四川司郎中一員，舊有主事一員，隆慶四年革。 雲南司郎中一員，舊有主事一員，隆慶三年革。 貴州司郎中一員，舊有主事一員，嘉靖三十七年革 司獄二員。
南京工部。
尚書一員，右侍郎一員。萬曆二年革。十一年復設司 務一員。
營繕司郎中一員，員外郎一員，嘉靖三十七年革，萬 曆十一年復設主事二員。舊有三員，嘉靖三十七年 革一員。
虞衡司，郎中一員，主事二員。萬曆九年革一員。十一 年復設。
都水司郎中一員。舊有員外郎一員。嘉靖三十七年 革。主事一員。內一員、管新江口船隻
屯田司，郎中一員，主事二員。內一員嘉靖三年添設 所屬衙門：營繕所所正、所副所丞各一員。龍江提舉 司提舉一員。文思院，舊有大使一員，嘉靖三十七年 革。寶源局大使一員。軍器局大使一員，舊有副使一
