湖北神農架動物模式標本名錄

湖北神農架動物模式標本名錄
作者：吳楠　雷博宇　周友兵　謝宗強
2020年1月17日

本作品收錄於《中國科學數據》

吳楠, 雷博宇, 周友兵, 謝宗強. 湖北神農架動物模式標本名錄[J/OL]. 中國科學數據, 2019. (2020-01-13). DOI: 10.11922/csdata.2019.0042.zh.

摘要&關鍵詞

摘要：模式物種是新種發表的依據，在分類學及相關科學研究中具有重要意義。本數據集在《神農架動物模式標本名錄》和《中國昆蟲模式標本名錄》（第1、2、3卷）的基礎上，對湖北省神農架地區的動物模式標本進行了信息匯總、核實、厘定和整理。包含了以采自神農架地區的標本為模式標本確立的動物物種915種，隸屬於3門8綱31目187科，以及14種厘定為無效模式標本的物種。本數據集中的每條記錄都涵蓋了相應物種的有效性、分類信息、模式標本（正模配模和副模）的數量、採集地點、採集時間、原始文獻中的標本存放地、是否憑證標本僅來自於神農架地區、參考文獻及備註，對相關分類學及科學研究具有重要的參考價值，可為湖北省動物保護工作提供科學依據。

關鍵詞：神農架；模式標本；動物

Abstract & Keywords

Abstract: Type specimens are the basis of the publication of new species and are of great significance in taxonomy and related scientific research. This dataset summarizes, verifies, and determines the animals』 type specimens in Shennongjia, Hubei Province, China, based on the book Catalogue of the Animal Type Specimens Deposited in Shennongjia and the series of books Catalogue of the Insect Type Specimens Deposited in China (Volumes 1, 2, 3). The dataset covered 915 animal species including type specimens collected from Shennongjia area (3 phylums, 8 classes, 31 orders and 187 families). Meanwhile, 14 species that used to be identified as ineffective specimens were specifically compiled. In this dataset, each record covered availability and classification information of corresponding species, number of type specimens (i.e., holotype, allotype and paratype), collection location, collection time, specimen storage location in the original literature, whether the specimens were merely from Shennongjia, reference materials and remarks. This dataset effectively supported the related taxonomy and scientific research, and hopefully it can provide a scientific basis for animal protection work, Hubei Province, in the near future.

Keywords: Shennongjia; type specimens; animals

數據庫（集）基本信息簡介

數據庫（集）名稱	湖北神農架動物模式標本名錄
數據作者	吳楠，雷博宇，周友兵，謝宗強
數據通信作者	謝宗強（xie@ibcas.ac.cn）
數據時間範圍	文獻發表時間：1950–2016年；物種採集時間：1957–2014年
地理區域	湖北神農架（東經109°29′34.8″–111°56′24″、北緯30°57′28.8″–32°14′6″）
數據格式	*.xlsx
數據量	249 KB
數據服務系統網址	http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/861
基金項目	CERN監測網絡，國家生態系統觀測研究共享服務平台（2005DKA10300）。
數據庫（集）組成	整個數據集共由929條記錄組成，分別包括（1）以采自神農架的標本為模式標本確定的動物物種915種，隸屬於3門8綱31目187科；（2）14種甄別為無效模式標本的物種。數據內容由31個部分組成，分別為：編號、物種有效性、門、門拉丁名、綱、綱拉丁名、目、目拉丁名、科、科拉丁名、屬拉丁名、中文名、拉丁學名、正模數量、正模性別、正模採集地點、正模採集時間、正模原始文獻中的標本存放地、配模數量、配模性別、配模採集地點、配模採集時間、配模原始文獻中的標本存放地、副模數量、副模性別、副模採集地點、副模採集時間、副模原始文獻中的標本存放地、憑證標本是否僅來自於神農架地區、參考文獻及備註。

Dataset Profile

Title	The catalogue of animal type specimens in Shennongjia, Hubei Province, China
Data authors	Nan Wu, Boyu Lei, Youbing Zhou, Zongqiang Xie
Data corresponding authors	Xie Zongqiang（xie@ibcas.ac.cn）
Time range	Publication time: From 1950 to 2016; Collection time: From 1957 to 2014
Geographical scope	Shennongjia, Hubei Province, China (109°29′34.8″–111°56′24″E, 30°57′28.8″–32°14′6″N).
Data format	*.xlsx
Data volume	249 KB
Data service system	<http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/861>
Sources of funding	CERN，National Ecosystem Observation and Research Sharing Service Platform Project (2005DKA10300).
Dataset composition	This data consisted of 929 records, including: (1) 915 animal species which type specimens collected from Shennongjia area, belonging to 3 phylums, 8 classes, 31 orders and 187 families; (2) 14 species that used to be identified as ineffective specimens were specifically compiled. The data also consisted of 31 parts, respectively was: species number, species availability, phylum, phylum Latin name, class, class Latin name, order, order Latin name, family, family Latin name, genus Latin name, species Chinese name, species Latin name; type specimens number, gender, collection location, collection time, the specimen storage location in the original literature (i.e., holotype, allotype and paratype, respectively); whether the specimens are only from Shennongjia area, reference materials and remarks.

引 言

神農架位於中國地勢第二階梯的東部邊緣，地處鄂渝陝交界，為大巴山脈東段中山地貌。經專家諮詢和研討，依據地質歷史和地形地貌特點將其自然地理範圍確定為東經109°29′34.8″–111°56′24″、北緯30°57′28.8″–32°14′6″，面積約12837 km^[1]。神農架東起湖北保康縣，西至陝西鎮坪縣，南達湖北巴東縣，北至湖北竹谿縣。區域範圍的主體是湖北神農架林區，同時還囊括湖北興山縣、秭歸縣、巴東縣、房縣、竹山縣、竹谿縣、保康縣和重慶巫山縣、巫溪縣及陝西鎮坪縣10個縣^[2]。該區域地處中國東部平原丘陵向西部高原山地過渡及亞熱帶氣候向暖溫帶氣候過渡的地區，具北亞熱帶季風氣候特點^[3]。神農架是動植物種類的交匯地和第四紀冰川時期野生動植物的「避難所」，擁有豐富的生物多樣性，並於2016年被列入《世界遺產名錄》。

一直以來，作為新種發表和物種命名的依附實體，模式標本既是系統分類研究不可缺少的科學依據，也是研究學者開展專科專屬研究，編寫全國和地方生物志，進行生物區系調查研究、開發、利用和保護生物資源的重要基本資料^{[4][5][6][7][8]}。模式標本的數量是一個國家或地區分類學研究積累的重要反映，其數量越多說明該地區的相關研究越深入，受關注度的程度越高，進行分類與區系研究也就越便利^[9][8]。因此，模式物種具有極高的學術價值和保藏價值。

神農架是全球具有國際意義的生物多樣性研究與保護關鍵地區之一，亦是中國種子植物特有屬三大分布中心之一，歷來受到分類學家的青睞^[2]。18世紀後，國內外科學家對神農架開展過多次科學考察，採集並命名了多種動植物物種^{[10][11][12][13]}。新中國成立後，中國科學家對湖北神農架先後開展了地質、地貌、植物、動物、氣候等方面的綜合調查與研究，並發表了一系列論文與專著，如《神農架魚類》（內部資料）《神農架自然保護區科學考察集》^[13]《神農架地區自然資源綜合調查報告》^[11]等。但是，對於該地區模式動物的研究相對匱乏，且存在研究內容較為分散、信息更新不夠及時等問題。因此，很有必要對神農架地區的動物模式物種及其分類厘定進行整合，以便能較好了解湖北省神農架地區動物模式標本的種類信息及其分類變動，為湖北省野生動物保護工作做好鋪墊。

本數據集在參考《神農架動物模式標本名錄》^[2]《中國昆蟲模式標本名錄》（第1、2、3卷）^[4][5][6]等資料的基礎上，對採集並發表於湖北神農架地區的動物模式標本的原始發表文獻、標本數量及標本存放機構進行了系統整理，確定了物種有效性和分類歸屬，儘可能整合最新的研究成果，同時聽取專家意見。最終，在專著《神農架動物模式標本名錄》的基礎上，整理匯總出一套相對完整的湖北神農架地區的動物模式標本名錄數據集。

1 數據採集和處理方法

1.1 數據採集

在《神農架動物模式標本名錄》的基礎上，參考了《中國昆蟲模式標本名錄》（第1、2、3卷）的分類體系，並通過以下方式進行數據的採集：①以「Shennongjia」和「New species」在Scholar Google（http://www.scholar.google.com/）和Web of Science（http://www.isiknowledge.com）网站上搜索英文文献；②以“神农架”和“新种”在Scholar Google、中國知網（http://www.cnki.net/）和维普网（http://www.cqvip.com/）上搜索中文文献；③查阅相关的志书^{[14][15][4][6]}和專題網站（中國昆蟲模式標本數據庫 -http://www.zoology.csdb.cn/page/showEntity.vpage?uri=specimen.specimen 及中國昆蟲新種數據庫http://www.zoology.csdb.cn/page/showEntity.vpage?uri=newinsect.species1）。

1.2 處理方法

我們參考了《中國昆蟲模式標本名錄》（第1、2、3卷）、《長江三峽庫區昆蟲》（上、下）^[14][15]等專著和國內外發表的文獻或書籍，將其中於湖北神農架區域內分布的動物模式物種標本信息匯總整理，同時對模式物種進行分類厘定。本數據集中只列出模式物種在神農架地區的分布信息（正模、配模、副模分別的數量、性別、採集地點、採集時間、原始文獻中的標本存放地、參考文獻）。基於《神農架動物模式標本名錄》一書，本數據集於「備註」部分羅列了部分需要分類討論的物種，具體內容可參考該書。

2 數據樣本描述

本數據集中的名錄共由929條記錄組成，主要分為2個部分，分別是（1）有效物種名錄：以采自神農架的標本為模式標本確定的動物物種915種，隸屬於3門8綱31目187科；（2）無效物種名錄：14種甄別為無效模式標本的物種。本數據集涵蓋了模式物種分類信息（物種編號、物種有效性、物種所屬的分類階元及物種中文名和拉丁學名）、模式標本信息（正模、配模、副模分別的數量、性別、採集地點、採集時間、原始文獻中的標本存放地）、文獻信息（包括物種發表的原始文獻及分類修訂的相關文獻）、憑證標本是否僅來自於神農架地區及備註。具體的字段名稱、類型及示例見表1。

表1 湖北神農架動物模式標本名錄示例

字段名	數據類型	數據樣本
編號	數值型	55
物種有效性	字符型	有效
門	字符型	節肢動物門
門拉丁名	字符型	Arthropoda
綱	字符型	蛛形綱
綱拉丁名	字符型	Arachnida
目	字符型	蜘蛛目
目拉丁名	字符型	Araneae
科	字符型	皿蛛科
科拉丁名	字符型	Linyphiidae
屬拉丁名	字符型	Gongylidioides
中文名	字符型	穿孔瘤胸蛛
拉丁學名	字符型	Gongylidioides foratus
正模數量	數值型	1
正模性別	字符型	♂
正模採集地點	字符型	湖北神農架木魚鎮
正模採集時間	字符型	1986. Ⅵ~Ⅷ
正模原始文獻中的標本存放地	字符型	白求恩醫科大學生物學教研室
配模數量	數值型	1
配模性別	字符型	♀
配模採集地點	字符型	湖北神農架木魚鎮
配模採集時間	字符型	1986. Ⅵ~Ⅷ
配模原始文獻中的標本存放地	字符型	白求恩醫科大學生物學教研室
副模數量	數值型	24
副模性別	字符型	14♀♀10♂♂
副模採集地點	字符型	湖北神農架木魚鎮
副模採集時間	字符型	1986. Ⅵ~Ⅷ
副模原始文獻中的標本存放地	字符型	白求恩醫科大學生物學教研室
憑證標本是否僅來自於神農架地區	字符型	是
參考文獻	字符型	(1) 馬曉麗, 朱傳典. 1990. 中國瘤胸蛛屬二新種 (蜘蛛目: 皿蛛科: 微蛛亞科).動物分類學報, 15: 431-435. (2) Tu LH, Li SQ. 2006. A review of Gongylidioides spiders (Araneae: Linyphiidae: Erigoninae) from China. Revue Suisse de Zoologie, 113: 51-65.
備註	字符型	分類討論

3 數據質量控制和評估

本數據集是一個基於已出版的專著《神農架動物模式標本名錄》整合的數據資料集（庫）。在信息匯總、整理過程中，以《中國昆蟲模式標本名錄》（第1、2、3卷）作為分類階元的主要參考依據，嚴格遵循動物模式物種須有規範的模式標本（正模、配模、副模）描述、明確的模式標本存放地（正模、配模、副模分別在原始文獻中出現的存放地）、公開的學術刊物（原始發表文獻及分類厘定參考文獻）、明確的縣級（或村、鎮）記錄的原則。

模式標本的正模、配模和副模，若原始文獻未提供其明確的信息，則用「不詳」標註。本數據集中的所有數據均來源於公開發表的文獻或專著，且每條記錄後附有原始文獻，可供使用者查詢出處。

4 數據價值

模式標本的數量是一個國家或地區分類學研究積累的重要反映，具有極高的學術價值和保藏價值。自18世紀以來，分類學家及相關研究學者在湖北神農架地區開展了大量的科學考察活動，採集並發現了大批物種新記錄，撰寫了大量學術文章及專著。然而，直至今日，對於神農架地區模式動物的整合性研究仍較為匱乏，且目前的研究結果體現出研究內容較為分散、數據信息較為陳舊、信息更新不夠及時等問題。本數據集搜集整理了相關權威網站及發表時間跨度達80餘年的國內外文獻、專著，內容豐富、全面。本數據集可供從事動物學及保護生物學科研、教學的學者、自然保護科技工作者及自然資源管理人員查閱，為構建其他區域性或大尺度的模式標本數據集提供參考。

致 謝

中國科學院水生生物研究所張浩淼、華中農業大學劉曉艷提供了部分文獻，中國科學院植物研究所研究生余小林、崔繼法、王冰鑫以及安徽大學陳文文幫助查找了部分文獻，湖北神農架國家級自然保護區管理局李立炎、王大興、李純清、王志先等提供了相關資料，中國科學院植物研究所申國珍、熊高明、徐文婷、樊大勇、趙常明提供了寶貴建議，在此一併致謝。

參考文獻

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數據引用格式

吳楠, 雷博宇, 周友兵, 謝宗強. 湖北神農架動物模式標本名錄[DB/OL]. Science Data Bank, 2019. (2019-08-29). DOI: 10.11922/sciencedb.861.